图像分割预处理简单实用技巧

图像分割预处理简单实用技巧，少量代码轻松上手

AI Studio

1692人浏览 · 2021-11-19 10:26:35

AI Studio · 2021-11-19 10:26:35 发布

前言

前段时间参加了一个图像的分割比赛，因为是刚接触图像分割这一块，所以很多东西都不太懂得。搞完比赛后，就来写一个项目记录一下，方便像我这样的小白更好的理解一下图像分割预处理的一下小知识。

一些小小知识点

目标检测的labels对应的目标的类别与bbox的坐标参数

图像分类的labels对应就是文件名字的类别

而图像分割的labels对应的就是该物体的轮廓

相信很多小伙伴刚接触图像分割会遇到这样的情况，看了原图之后，再看原图对应的labels，发现是一张纯黑的图片（黑人问号脸？）。连图像的labels都看不到，那还怎么进行后面的研究呢。实际上这是因为图片的labels只用了0，1的取值所以看起来纯黑的图片，通常解决的办法是我们会把labels的取值1变成255；即把0，1二值变成0，255二值。 处理之后，就可以看到labels变成一张黑白的图片。

接下来就是介绍如何把一张labels“纯黑”的图片变成“黑白”图片

图像分割中我习惯labels称作为mask，因此后面的labels就当做是mask方便理解

一、mask之“显形”

PS:数据来源于胸部x光肺部分割数据，并进行了一定的处理后再展示使用。【部分展示】

我们来看原图

再看mask（0，1取值）

一片漆黑，啥也看不到，都不知道它分割的是哪部分。为了把mask“显形”就可以通过下面的程序进行处理，处理后就会变成这样的结果。经处理后我们就可以清晰看到原图的mask的到底是哪一部分

#导入必要的包
import PIL.Image as Image
from tqdm import tqdm
import numpy as np
import os
import time

data_path='HB_data/mask'#原图对应的mask图——0，1二值的黑色图片
data_path1='HB_data/c_mask'#保存mask图——0，255二值的黑白图片
for _, _, files in os.walk(data_path):    #批量化处理
        for f in tqdm(files):
            img = Image.open(os.path.join(data_path, f))
            img = np.asarray(img).copy()
            # print(img)
            img[img ==1 ] = 255
            # print(img)
            img = Image.fromarray(img)
            img.save(os.path.join(data_path1, f))

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其实原理还是比较简单的，就是用了numpy函数把图片数据弄成矩阵的数值，把矩阵里面为1的数值转化为255，然后再变成图片的数据便可显示。

另外如果想把0，255二值“黑白”照片变成0，1二值“纯黑”照片，可以把上面的1，255互换位置即可

mask显示出来了，但是要原图还有mask来回切换会显得有点不方便，看的有点眼花缭乱，要是图片里面种类多而且目标小，很难可以对的上。因此我们需要把原图和mask合并在一张图上，就是把mask的形状在原图“勾勒”出来。接下来就介绍如何“勾勒形状”。

二、mask之“勾勒形状”

这里我们使用的数据是眼底血管语义分割数据集，并进行了一定的处理。【部分展示】

Tips:这里我们使用的mask是0，255二值。原数据集是0，1二值，可以执行完第一步后再进行进行这一步。这里需要注意一个问题是，原图与mask都是要相同的数据格式才可以展示出来，如果格式不匹配就显示不出来效果

原图：

对应的mask：

“勾勒出形状”–mask映射回原图：

函数cv2.findContours(image, mode, method[, offset])

概述：寻找一个二值图像的轮廓。注意黑色表示背景，白色表示物体，即在黑色背景里寻找白色物体的轮廓

参数：

image:8位单通道图像。非零像素值视为1，所以图像视作二值图像
mode:轮廓检索的方式
cv2.RETR_EXTERNAL:只检索外部轮廓
cv2.RETR_LIST: 检测所有轮廓且不建立层次结构
cv2.RETR_CCOMP: 检测所有轮廓，建立两级层次结构
cv2.RETR_TREE: 检测所有轮廓，建立完整的层次结构

method:轮廓近似的方法
cv2.CHAIN_APPROX_NONE:存储所有的轮廓点
cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE:压缩水平，垂直和对角线段，只留下端点。 例如矩形轮廓可以用4个点编码。
cv2.CHAIN_APPROX_TC89_L1,cv2.CHAIN_APPROX_TC89_KCOS:使用Teh-Chini chain近似算法
offset:（可选参数）轮廓点的偏移量，格式为tuple,如（-10，10）表示轮廓点沿X负方向偏移10个像素点，沿Y正方向偏移10个像素点

函数cv2.drawContours(image, contours, contourIdx, color[, thickness[, lineType[, hierarchy[, maxLevel[, offset]]]])

概述绘制轮廓线或者填充轮廓

参数

image:需要绘制轮廓的目标图像，注意会改变原图
contours:轮廓点，上述函数cv2.findContours()的第一个返回值
contourIdx**:轮廓的索引，表示绘制第几个轮廓，-1表示绘制所有的轮廓
color:绘制轮廓的颜色
thickness:（可选参数）轮廓线的宽度，-1表示填充
lineType:（可选参数）轮廓线型，包括cv2.LINE_4,cv2.LINE_8（默认）,cv2.LINE_AA,分别表示4邻域线，8领域线，抗锯齿线（可以更好地显示曲线）
hierarchy:（可选参数）层级结构，上述函数cv2.findContours()的第二个返回值，配合maxLevel参数使用
maxLevel:（可选参数）等于0表示只绘制指定的轮廓，等于1表示绘制指定轮廓及其下一级子轮廓，等于2表示绘制指定轮廓及其所有子轮廓
offset:（可选参数）轮廓点的偏移量

#导入必要的包
import cv2
import os
from PIL import Image
import matplotlib.image as mpimg
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt 
from tqdm import tqdm

img_datapath='GL_data/images'#原图
mask_datapath='GL_data/mask'#对应的mask-0，255二值

for _, _, files in os.walk(img_datapath):  #批量化处理
    for f in tqdm(files):
        img = cv2.imread(os.path.join(img_datapath, f), 1)
        mask = cv2.imread(os.path.join(mask_datapath, f), 0)

        contours, _ = cv2.findContours(mask, cv2.RETR_TREE, cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE)#寻找轮廓
        cv2.drawContours(img, contours, -1, (0, 0, 255), 2)#绘制轮廓

        img = img[:, :, ::-1]
        img[..., 2] = np.where(mask == 1, 255, img[..., 2])

        # plt.imshow(img)
        # plt.show()

        img = Image.fromarray(img)
        img.save('GL_data/c_img'+'/'+f)#保存“勾勒形状”图片

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三、mask之“图像融合”

当然我们还可以使用Opencv：cv2.addWeighted() 图像融合对image和mask进行融合而不进行“勾勒“。融合的方式有两种：一种是OpenCV方式；一种是PIL方式。

下面是融合的效果：

OpenCV方式

PIL方式

可以看到其实融合的效果是一样的

# OpenCV方式：
import cv2
import os
from tqdm import tqdm

img_datapath='RH_data/images'#原图
mask_datapath='RH_data/mask'#对应的mask-0，255二值

#addWeighted()函数是将两张相同大小，相同类型的图片（叠加）线性融合的函数，可以实现图片的特效。

for _, _, files in os.walk(img_datapath):  #批量化处理
    for f in tqdm(files):
        image = cv2.imread(os.path.join(img_datapath, f))
        mask = cv2.imread(os.path.join(mask_datapath, f))
        mask_img = cv2.addWeighted(image, 0.7, mask, 0.3, 10) #image的权重为0.7，mask的权重为0.3
        #相当于对图片做一个亮度调整，gamma为0的话代表不调整，gamma为10,图片每个像素加上10，相当于提高亮度，这个值也可以是负的，即降低亮度。
        cv2.imwrite('RH_data/r_img'+'/'+f, mask_img)

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# PIL方式：

import cv2
import os
from tqdm import tqdm
import numpy as np
from PIL import Image

img_datapath='RH_data/images'#原图
mask_datapath='RH_data/mask'#对应的mask-0，255二值

for _, _, files in os.walk(img_datapath):  #批量化处理
    for f in tqdm(files):
        image = Image.open(os.path.join(img_datapath, f))
        mask = Image.open(os.path.join(mask_datapath, f))
        mask_img = Image.blend(image.convert('RGBA'),
                            mask.convert('RGBA'), 0.3) #数值可以自行调整，数值越大，mask占比越大
        mask_img.save('RH_data/r_img1'+'/'+f)

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四、mask之“简单上色”

我们此前用的分割后的图片都是单通道图像，因此没有色彩。如果要给分割后的图像显示出颜色，那就必须把原来图像的单通道变成三通道，也就是我们常说的rgb通道。首先我们要把单通道改为rgb通道，然后再对我们的rgb通道进行赋值（上色），也就是对我们矩阵里面的数字进行修改即可。

PS:数据来源于胸部x光肺部分割数据，并进行了一定的处理后再展示使用。【部分展示】

原来的mask，（0，255）二值：

可以根据个人喜好对原来的mask进行上色（如红色，绿色等）

当然我们也可以改变背景的颜色，例如背景是绿色，目标是红色：

import numpy as np
from PIL import Image


def generate_rgb(gray_array):
    print('gray_array.shape', gray_array.shape) #打印出灰度图的shape
    x, y = gray_array.shape 
    rgb = np.zeros([x, y, 3], int) #扩充为rgb通道
    # gray_array = np.array(gray_array) #化为矩阵形式
    for i in range(x):
        for j in range(y):
            if gray_array[i, j] == 255:  #目标体（原来是白色）
                rgb[i, j, 0] = 255       #rgb通道的，r（红色）通道
                rgb[i, j, 1] = 0         #rgb通道的，g（绿色）通道
                rgb[i, j, 2] = 0         #rgb通道的，b（蓝色）通道

#大家可以根据自己喜欢颜色进行对三通道进行赋值（即调色）

            if gray_array[i, j] == 0 :   #背景（原来是黑色）
                rgb[i, j, 0] = 0         #rgb通道的，r（红色）通道
                rgb[i, j, 1] = 255       #rgb通道的，g（绿色）通道
                rgb[i, j, 2] = 0         #rgb通道的，b（蓝色）通道
    
    return rgb

mask_datapath='color_data/mask'#对应的mask-0，255二值

for _, _, files in os.walk(mask_datapath):  #批量化处理
    for f in tqdm(files):
        source_img = Image.open(os.path.join(mask_datapath, f)) #读取照片
        source_img = np.array(source_img)    #化为矩阵
        img = generate_rgb(source_img)   #调用generate_rgb函数
        img = Image.fromarray(np.uint8(img))
        img.save('color_data/color_mask'+'/'+f)

  0%|          | 0/1 [00:00<?, ?it/s]

gray_array.shape (512, 512)


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0it [00:00, ?it/s]

拓展

我们可以把三通道分开来更好了解图像的特征

from PIL import Image
import matplotlib.pyplot as plt

img=Image.open('color_data/color_mask/2.png') #打开图像
gray=img.convert('L')   #转换成灰度
r,g,b=img.split()   #分离三通道
pic=Image.merge('RGB',(r,g,b)) #合并三通道

#原图
plt.figure("beauty")
plt.subplot(2,3,1), plt.title('origin')
plt.imshow(img)
#plt.axis('off') 坐标轴
#python中subplot的用法    subplot是python中子图的绘制 ，subplot(2,3,2)其中是两行三列，2表示绘制第二个

#灰度图
plt.subplot(2,3,2), plt.title('gray')
plt.imshow(gray,cmap='gray'),plt.axis('off')

#三通道合并图
plt.subplot(2,3,3), plt.title('merge')
plt.imshow(pic)
plt.axis('off')

#只有r通道图,因为上个程序rgb[i, j, 0] 设置了 255的时候为255，0的时候为0 所以就会显示为常用的0，255二值”黑白“图
plt.subplot(2,3,4), plt.title('r')
plt.imshow(r,cmap='gray')
plt.axis('off')

#只有g通道图，因为上个程序rgb[i, j, 1] 设置了 255的时候为0，0的时候为255 所以就会和上面r通道的图颜色相反
plt.subplot(2,3,5), plt.title('g')
plt.imshow(g,cmap='gray')
plt.axis('off')

#只有b通道图，因为上个程序rgb[i, j, 2] 设置了 255的时候为0，0的时候为0 ，因为取值都为0，所以是一张纯黑的图
plt.subplot(2,3,6), plt.title('b')
plt.imshow(b,cmap='gray')
plt.axis('off')
plt.show()

在这里插入图片描述

五、mask之“还原色彩”

把彩色的mask还原成0，255二值“黑白照”

效果如下：

原图：

转换后：

import matplotlib.pyplot as plt
import cv2
import numpy as np
color_img = cv2.imread("HY_colordata/1.jpg")#彩色照片
gray_image = cv2.cvtColor(color_img, cv2.COLOR_BGR2GRAY)#彩色照片转灰度照片
gray_image = np.asarray(gray_image).copy()
gray_image[gray_image > 100 ] = 255
plt.imshow(gray_image,cmap='Greys')
olor_img, cv2.COLOR_BGR2GRAY)#彩色照片转灰度照片
gray_image = np.asarray(gray_image).copy()
gray_image[gray_image > 100 ] = 255
plt.imshow(gray_image,cmap='Greys')
plt.show()